Този клон на индустриална микробиология, занимаващи се с текстилни материали. Повечето от микроорганизми на текстил-гъби, актиномицети и бактерии-произхождат от въздуха, почвата и водата. Някои от микроорганизмите са вредни или влакна или потребителя. Те могат да се разграждат целулозата или протеин в влакна или върху здравето на потребителите. , Тъй като съдържанието на минимална влага за развитие на микроорганизми е 7 %, сухо съхранение е мярка за ефективна превенция. Някои от микроорганизмите са полезни, например в процеса на накисване, в която влакна са освободени от стъблата на растенията такива влакна, лен, коноп и Юта.